● PPI-pfam Validation

We constructed the structure images of three proteins among the primary PPI-Pfam validation pairs. - What is PPI-Validation? (link)


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● PCI Validation

We constructed the protein-chemical docking images from three PCI validation pairs among many others. - What is PCI-Validation? (link) 
 
 
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● The following news article is the source from which ANGPTL4 was selected for our review.

 대장암에서 가장 풍부하게 발견되는 COX-2가 유도하는 prostaglandin 인 Prostaglandin E2 (PGE2)는 다양한 신호전달 경로들
을 통해 종양 세포의 증식과 생존을 촉진시킨다. 그러나 종양 저산소증 (hypoxia)에서 PGE2 의 역할은 아직까지 이해되지 않고
있다. PGE2 와 저산소증이 angiopoietin-like protein 4 (ANGPTL4)의 발현을 증가시키는 효과가 있고 ANGPTL4 는 대장암의 성
장을 촉진시킨다고 미국 The University of Texas MD Anderson Cancer Center 의 Raymond N. DuBois 박사 연구팀이 최근 논
문에서 발표했다 (Cancer Research, 2011, 71(22); 7010?20). PGE2 는 저산소증 조건에서 ANGPTL4 의 mRNA 와 단백질을 유
도한다.
 또한 저산소증은 EP1 라 불리는 PGE2 수용체들 중 하나를 유도한다. EP1 의 활성화는 ANGPTL4의 발현을 증가시키지만 길항
제에 의한 EP1 차단은 저산소증 조건 하에서 PGE2 가 유도하는 ANGPTL4 의 유도를 막았다. 중요하게 ANGPTL4 의 과다발현은
세포 배양과 생체 내에서 종양의 증식과 성장을 촉진시켰다. 또한 ANGPTL4 재조합 단백질로 처리하면 STAT1 신호전달에 대한 효
과를 통해 대장 암 증식이 증가된다. MAP 카이네이즈와 Src 경로들은 ANGPTL4 이 유도하는 STAT1 발현과 활성화를 매개한다. ANGP
TL4 와 STAT1 의 발현은 인간 대장암의 50% 에서 증가되어 있고 대장암에서 COX-2 와 ANGPTL4 또한 STAT1 의 양성적 관계가 존재
하기 때문에 이러한 결과들은 인간의 암과 관계가 있음을 의미하고 있다. 종합해 볼 때 이러한 발견들은 PGE2가 저산소증 조건에서 AN
GPTL4를 통해 암 세포의 증식을 촉진시키는 중요한 역할을 하고 있음을 제안하고 있다.
최근 증거들은 아스피린이나 비스테로이드 항-염증 약물을 정기적으로 취하는 개인들에서 대장암과 다른 암들의 위험성이 감소하는 현
상을 확인하고 있다. 이러한 약물들은 COX-1 와 COX-2의 강력한 길항제이다. COX-2의 증가는 대장암의 약 50% 정도에서 발견되고
선암종 (adenocarcinomas)의 85% 에서 발견된다. COX-2는 자유 아라키돈 산 (arachidonic acid)을 prostaglandins (PG) 와 thromb
oxanes (TX)를 포함하는 prostanoids로 전환시킨다. Prostaglandin E2 (PGE2)는 대장암에서 발견되는 가장 풍부한 prostaglandin 이
다.
많은 증거들은 PGE2 이 대장암에서 COX-2의 종양 촉진 효과를 매개하고 있음을 보여주었다. PGE2 치료는 ApcMin/+ 생쥐에서 소장
과 대장의 선암 발생을 현저히 증가시키고 azoxymethane 이 유도하는 대장 종양의 발생과 다양성을 증가시킨다. PGE2은 EP 수용체
신호전달을 자극하여 세포 증식, 신혈관형성 촉진, 암 세포사멸을 억제하고 침투와 이동성을 향상시켜 종양의 성장을 촉진시킨다. 저산
소증은 암 진행과 전이의 조절에서 지금까지 동정된 가장 일반적이고 핵심적인 요소들 중 하나이다. 종양 세포들이 저산소증에 적응하는
것은 암세포들이 생존하고 더욱 악성이거나 침투적이게 하는 유전적 변화를 통해 유도된다.
저산소증은 대장암에서 저산소증적인 반응을 조절하는 주요한 전사인자인 hypoxic-inducible factor (HIF)-1을 통해 COX-2 와 PGE2
의 발현을 유도한다. 저산소증 과정에서 PGE2 의 증가된 수준은 HIF-1 전사 활동을 증가시켜 대장암의 성장과 생존을 촉진시킨다. 따
라서 이러한 결과는 PGE2와 저산소증간에 존재하는 상호작용의 가능성을 제안하고 있다. 그러나 PGE2 이 저산소 종양 미세 환경에서
대장암의 진행을 촉진시키는 기작은 명확하지 않다. 연구팀은 종양 저산소증과 암 진행에 연관성이 있는 저산소증에 대한 핵심적인 종양
적응 반응을 PGE2 이 매개할 것으로 가정했다. Angiopoietin-like protein 4 (ANGPTL4)는 순환하는 triglycerides의 축적을 조절하는 N
-terminal coiled-coil fragment(N-ANGPTL4)과 C-terminal fibrinogen-like domain(C-ANGPTL4)으로 절단되는 분비 단백질이다.
지방 신진대사에서 ANGPTL4의 역할은 잘 정의되었지만 암 진행에서 그 역할은 잘 이해되지 않고 있다. ANGPTL4 이 암 진행에 관여되
어 있다고 최근 연구들은 제안하고 있지만 신혈관형성과 암 진행에서 ANGPTL4 의 정확한 역할은 아직도 논쟁 중 이다. 예를 들어 서로
다른 모델에서 ANGPTL4가 신혈관 형성 촉진과 항-신혈관 형성의 서로 반대가 되는 효과를 발휘한다고 보고 되었다. 또한 ANGPTL4 가
TGFb 에 의한 유방 암의 폐 전이를 매개하지만 흑색종의 전이는 막는다고 알려져 있다. 이러한 상충되는 결과는 암 진행에서 ANGPTL4
의 역할을 밝히는 추가 연구의 필요성을 강조하고 있다.
이번 연구에서 ANGPTL4 은 대장 암 세포에서 PGE2 와 저산소증 신호전달 경로들 간의 상호작용의 새로운 핵심적인 요소로 동정되었
다. 이번 결과는 EP1를 통해 ANGPTL4 발현의 유도에 PGE2 와 저산소증이 시너지 효과를 발휘함을 보여주고 있다. 더욱 중요한 것은
ANGPTL4 의 증가가 세포 배양과 생체 내에서 종양의 성장을 촉진시키는 결과를 얻어낸 것이다. 또한 연구팀은 STAT1을 ANGPTL4 의
새로운 목표물로 동정했고 STAT1의 억제가 ANGPTL4 이 유도하는 대장암 세포 증식을 완화시킨다고 설명했다. 연구팀은 STAT1의 발
현과 활성화에 반응하는 ANGPTL4의 신호전달 경로들을 밝혀냈다. ANGPTL4 의 최대 유도를 위해서 저산소증과 PGE2가 모두 요구되
었다. 이러한 결과는 암 신호전달 경로들에 영향을 주는 종양 미세환경 내에서 복합적인 요소들의 상호작용을 암시하고 있다. 이번 연구
결과는 대장암의 증식에서 저산소증과 Prostaglandin E2 (PGE2)이 유도하는 angiopoietin-like protein 4 의 새로운 역할을 밝힘으로
대장암 치료의 새로운 목표물을 제시했다는데 그 의미가 있다.
(그림 설명) 저산소증 조건하에서 PGE2 이 ANGPTL4의 발현을 향상시키는 결과. A 와 B, LS-174T 세포를 서로 다른 PGE2의 농도로
처리하여 12 시간 (mRNA) 이나 48 시간 동안(단백질) 정상이나 저산소증에 노출시켜 ANGPTL4 의 발현을 측정한 결과. ANGPTL4 mR
NA (A) 와 (B) 단백질의 수준은 qRT-PCR 와 ELISA로 각각 측정함. C, ELISA 분석은 정상이나 저산소증 또는 dimethyl sulfoxide (DM
SO)에 48 시간 노출시킨 후 HT-29 (왼쪽) 과 HCT-116 (오른쪽) 세포 배양에서 얻어낸 결과.

http://cancerres.aacrjournals.org/content/71/22/7010.abstract?sid=2136db64-3d72-40b2-96b2-fda519530f04
Source Institution: The University of Texas MD Anderson Cancer Center
Source Author: Sun-Hee Kim et al.
Original Link: http://bric.postech.ac.kr/trend/news/view_kisti.php?id=197596